Pues es amplio el abanico de posibilidades que tenemos en linux para ya bien sea simplemente reproducir modulos
musicales o para crear nuevos.
Aqui va la lista:
Cheesetracker
Con cheese tracker podemos generar nuevos modulos y tambien reproducir: xm, it, s3m y ct (extension para los modulos de cheese tracker).
Al grabar un modulo podemos hacerlo como it (impulse tracker v.2.14) o bien como ct.
Es bastante intuitivo.

Mikmod
Sirve para reproducir modulos con la peculiaridad de poder listar la lista de los samples e instrumentos asi como de generar una playlist.
Reproduce xm, ult, stm,s3m, mod, mtm
Muy comodo en su manejo salvo para abrir un modulo o una playlist, tenedremos que indicar la ruta no permitiendo navegar atraves de los directorios del disco o discos. Podemos lanzarlo añadiendo el nombre del archivo a reproducir y por tanto pudiendo integrarlo en algún script o generar scripts para la creacion de playlists y luego lanzarlo para leer esa playlist.

gmod y xgmod
xgmod es la gui de este reproductor de modulos.
Es un reproductor solo para tarjetas GUS (gravis ultra sound) y reproduce:
mod de 4/6/8 pistas, s3m, 669, mtm, ult y xm.

sidplay2 y xsidplay
xsidplay es la interface grafica de sidplay.
sidplay emula el chip “Sound Interface Device” (SID) y el micro del Commodore 64 y nos permite reproducir sids :D.
La web oficial del programa es http://sidplay2.sourceforge.net/

goattracker
Un editor de sids para C64 muy majo.
Más info aqui: http://en.wikipedia.org/wiki/GoatTracker

xmp
Tambien xmp-x11 (la gui), es con toda probabilidad el mejor player de modulos que podemos encontrar en linux.
Se come practicamente todos los modulos de trackers conocidos y desconocidos.
Existe un plugin para que xmms use xmp y poder por tanto usar xmms para reproducirlos.
He dicho que es la ostia?, es la ostia.
Reproduce esto:
XM (Fast Tracker II), MOD (Noise/Fast/Protracker), FLT (Startrekker/Audio
Sculpture), ST (Soundtracker), IT (Impulse Tracker), S3M (Scream Tracker
3), STM (Scream Tracker 2), STX (STMIK 0.2), MTM (Multitracker), MTN
(Soundtracker 2.6/Ice Tracker), IMF (Imago Orpheus), PTM (Poly Tracker),
MDL (Digitrakker), ULT (Ultra Tracker), LIQ (Liquid Tracker), NO (Liquid
Tracker (old)), MASI (Epic Megagames MASI), PSM (Protracker Studio), AMF
(DSMI (DMP)), GDM (Generic Digital Music), MMD0/1 (MED 2.10/OctaMED),
MMD2/3 (OctaMED v5/OctaMED SS), MED3 (MED 2.00), MED4 (MED 2.10), DMF
(X-Tracker), RTM (Real Tracker), PT3 (Protracker 3), TCB (TCB Tracker),
DTM (Digital Tracker), GTK (Graoumf Tracker), DTT (Desktop Tracker), MGT
(Megatracker), MUSX (Archimedes Tracker), DSYM (Digital Symphony), DIGI
(DIGI Booster), DBM (DigiBooster Pro), EMOD (Quadra Composer), OKT
(Oktalyzer), SFX (SoundFX), FAR (Farandole Composer), UMX (Epic Games
Unreal/UT), STIM (Slamtilt), MTP (Soundsmith/MegaTracker), IMS (Images
Music System), 669 (Composer 669), FNK (Funktracker), AMD (Amusic Adlib
Tracker), RAD (Reality Adlib Tracker), HSC (HSC-Tracker), ALM (Aley Keptr),
AC1D (AC1D Packer), FCHS (Fuchs Tracker), FCM (FC-M Packer), FUZZ (Fuzzac
Packer), KRIS (ChipTracker), KSM (Kefrens Sound Machine), MP (Module
Protector), P18A (Promizer 1.8a), P10C (Promizer 1.0c), PRU1 (Prorunner
1.0), PRU2 (Prorunner 2.0), PHA (Pha Packer), WN (Wanton Packer), UNIC
(UNIC Tracker), TP3 (Tracker Packer v3), XANN (XANN Packer), MP (Module
Protector noID), DI (Digital Illusions), EU (Eureka Packer), P4x (The
Player 4.x), P60A (The Player 6.0a), NP2 (Noisepacker v2), NP1
(NoisePacker v1), NP3 (Noisepacker v3), ZEN (Zen Packer), UNIC (UNIC
Tracker id0), UNIC (UNIC Tracker noid), UNIC2 (Unic Tracker 2), CRB
(Heatseeker 1.0), TDD (The Dark Demon), GMC (Game Music Creator)
Si no nos tira leeremos bien xmp -h
A mi por ejemplo me tira asi:
xmp -d alsa
De todos modos podemos configurarlo en sus archivos de configuración para que nos rule de acuerdo a nuestro servidor de sonido.
por defecto suele tirar correctamente.
Y bueno, tenemos mucho más:
Soundtracker (tracker)
schism (un clon del impulse tracker)
s3mod (player)
yampmod (player)
nspmod (player)
mod (player)